Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3galt2Q3V1N9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3galt2Q3V1N9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A3galt2Q3V1N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms