Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
4930567H17RikQ3V0K5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930567H17RikQ3V0K5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms