Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm10Q3UTQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm10Q3UTQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm10Q3UTQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms