Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc177Q3UHB8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc177Q3UHB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc177Q3UHB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc177Q3UHB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms