Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lingo4Q149C3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Lingo4Q149C3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lingo4Q149C3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lingo4Q149C3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms