Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VgfQ0VGU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VgfQ0VGU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VgfQ0VGU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VgfQ0VGU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms