Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rundc1Q0VDN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rundc1Q0VDN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rundc1Q0VDN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms