Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h18Q0P678 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms