Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms