Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CbfbQ08024 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CbfbQ08024 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CbfbQ08024 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms