Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r236Q05A06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms