Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top1Q04750 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top1Q04750 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms