Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax5Q02650 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax5Q02650 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms