Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx2Q00262 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx2Q00262 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx2Q00262 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx2Q00262 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx2Q00262 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx2Q00262 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx2Q00262 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms