Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Psme1P97371 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psme1P97371 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Psme1P97371 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psme1P97371 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Psme1P97371 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Psme1P97371 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psme1P97371 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psme1P97371 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms