Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtnsP57757 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtnsP57757 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms