Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samsn1P57725 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samsn1P57725 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms