Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CartptP56388 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CartptP56388 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CartptP56388 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CartptP56388 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CartptP56388 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CartptP56388 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CartptP56388 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CartptP56388 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CartptP56388 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CartptP56388 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CartptP56388 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CartptP56388 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CartptP56388 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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CartptP56388 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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CartptP56388 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CartptP56388 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CartptP56388 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CartptP56388 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CartptP56388 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CartptP56388 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CartptP56388 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CartptP56388 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CartptP56388 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms