Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a1P55014 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc12a1P55014 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a1P55014 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms