Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pms2P54279 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pms2P54279 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pms2P54279 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pms2P54279 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pms2P54279 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pms2P54279 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pms2P54279 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pms2P54279 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pms2P54279 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pms2P54279 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pms2P54279 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pms2P54279 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pms2P54279 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pms2P54279 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pms2P54279 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pms2P54279 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pms2P54279 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pms2P54279 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pms2P54279 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pms2P54279 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pms2P54279 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms