Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms