Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SsbP32067 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SsbP32067 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SsbP32067 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SsbP32067 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SsbP32067 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SsbP32067 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SsbP32067 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SsbP32067 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SsbP32067 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SsbP32067 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SsbP32067 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SsbP32067 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SsbP32067 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SsbP32067 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SsbP32067 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SsbP32067 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SsbP32067 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SsbP32067 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SsbP32067 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SsbP32067 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SsbP32067 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SsbP32067 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SsbP32067 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SsbP32067 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SsbP32067 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SsbP32067 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SsbP32067 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SsbP32067 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SsbP32067 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SsbP32067 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SsbP32067 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SsbP32067 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms