Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept4P28661 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept4P28661 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept4P28661 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept4P28661 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept4P28661 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept4P28661 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept4P28661 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept4P28661 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept4P28661 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept4P28661 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms