Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf239P24399 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms