Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PparaP23204 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PparaP23204 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PparaP23204 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PparaP23204 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PparaP23204 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PparaP23204 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PparaP23204 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PparaP23204 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PparaP23204 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PparaP23204 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PparaP23204 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PparaP23204 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PparaP23204 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PparaP23204 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PparaP23204 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PparaP23204 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PparaP23204 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PparaP23204 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PparaP23204 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PparaP23204 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PparaP23204 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PparaP23204 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PparaP23204 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PparaP23204 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PparaP23204 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PparaP23204 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PparaP23204 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PparaP23204 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PparaP23204 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PparaP23204 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PparaP23204 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PparaP23204 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PparaP23204 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PparaP23204 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PparaP23204 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PparaP23204 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PparaP23204 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PparaP23204 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PparaP23204 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PparaP23204 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PparaP23204 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PparaP23204 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PparaP23204 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PparaP23204 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PparaP23204 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PparaP23204 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms