Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptbp1P17225 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptbp1P17225 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms