Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou4f1P17208 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms