Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna3P16390 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna3P16390 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kcna3P16390 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna3P16390 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna3P16390 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna3P16390 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms