Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd5P13379 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd5P13379 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd5P13379 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms