Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tnp1P10856 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms