Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2aP08775 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2aP08775 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms