Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prm2P07978 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Prm2P07978 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms