Protein–RNA interactions for Protein: O89053

Coro1a, Coronin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1aO89053 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Coro1aO89053 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Coro1aO89053 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Coro1aO89053 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Coro1aO89053 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Coro1aO89053 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Coro1aO89053 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Coro1aO89053 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Coro1aO89053 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms