Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JtbO88824 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JtbO88824 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JtbO88824 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JtbO88824 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JtbO88824 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
JtbO88824 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JtbO88824 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JtbO88824 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JtbO88824 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JtbO88824 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JtbO88824 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms