Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorl1O88307 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.1 ms