Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx7O70439 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx7O70439 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms