Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn5O54942 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn5O54942 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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