Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgals6O54891 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgals6O54891 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms