Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TsksO54887 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TsksO54887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TsksO54887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TsksO54887 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TsksO54887 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TsksO54887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TsksO54887 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TsksO54887 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TsksO54887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TsksO54887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TsksO54887 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TsksO54887 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TsksO54887 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TsksO54887 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TsksO54887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TsksO54887 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TsksO54887 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TsksO54887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TsksO54887 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TsksO54887 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TsksO54887 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TsksO54887 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TsksO54887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TsksO54887 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TsksO54887 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TsksO54887 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TsksO54887 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TsksO54887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TsksO54887 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TsksO54887 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TsksO54887 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TsksO54887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms