Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcns1O35173 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcns1O35173 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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