Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2056J3QQ02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2056J3QQ02 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms