Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmigd3G3X8R9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmigd3G3X8R9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms