Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8444F6XS56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8444F6XS56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8444F6XS56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8444F6XS56 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms