Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Trappc8E9PWG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Trappc8E9PWG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Trappc8E9PWG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trappc8E9PWG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms