Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU019823E9PUQ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AU019823E9PUQ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AU019823E9PUQ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU019823E9PUQ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AU019823E9PUQ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms