Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt2E9PUL5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt2E9PUL5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt2E9PUL5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt2E9PUL5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms