Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc18b1D3Z5L6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc18b1D3Z5L6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms