Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc5C3VPR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc5C3VPR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms