Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apba1B2RUJ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apba1B2RUJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apba1B2RUJ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms