Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Brpf3B2KF05 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf3B2KF05 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms